MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	A	7	7	965	971	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
2	NC_017484	GT	3	6	1008	1013	0 %	50 %	50 %	0 %	385829560
3	NC_017484	GAAA	2	8	1019	1026	75 %	0 %	25 %	0 %	385829560
4	NC_017484	AGAAA	2	10	1030	1039	80 %	0 %	20 %	0 %	385829560
5	NC_017484	TTG	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829560
6	NC_017484	TCA	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829560
7	NC_017484	ACA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829560
8	NC_017484	ATTT	2	8	1158	1165	25 %	75 %	0 %	0 %	385829560
9	NC_017484	AGA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
10	NC_017484	T	7	7	1187	1193	0 %	100 %	0 %	0 %	385829560
11	NC_017484	GAC	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829560
12	NC_017484	AAG	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
13	NC_017484	A	6	6	1240	1245	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
14	NC_017484	A	6	6	1249	1254	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
15	NC_017484	TAAAGG	2	12	1280	1291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385829560
16	NC_017484	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829560
17	NC_017484	CGGA	2	8	1523	1530	25 %	0 %	50 %	25 %	385829560
18	NC_017484	GA	3	6	1529	1534	50 %	0 %	50 %	0 %	385829560
19	NC_017484	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
20	NC_017484	ATGA	2	8	1902	1909	50 %	25 %	25 %	0 %	385829560
21	NC_017484	TAT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829560
22	NC_017484	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
23	NC_017484	GAA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
24	NC_017484	ATA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829560
25	NC_017484	A	6	6	2070	2075	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
26	NC_017484	AT	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	385829561
27	NC_017484	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
28	NC_017484	AGT	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829561
29	NC_017484	ATTC	2	8	2212	2219	25 %	50 %	0 %	25 %	385829561
30	NC_017484	ACT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829561
31	NC_017484	A	8	8	2230	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
32	NC_017484	T	8	8	2245	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	385829561
33	NC_017484	ACA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829561
34	NC_017484	ATA	2	6	2272	2277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829561
35	NC_017484	A	6	6	2277	2282	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
36	NC_017484	ACC	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
37	NC_017484	CAG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
38	NC_017484	ACC	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
39	NC_017484	CAG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
40	NC_017484	ACC	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
41	NC_017484	CAG	2	6	2381	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
42	NC_017484	ACC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
43	NC_017484	CAG	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
44	NC_017484	ACC	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
45	NC_017484	CAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
46	NC_017484	ACC	2	6	2460	2465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
47	NC_017484	CAG	2	6	2480	2485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
48	NC_017484	ACC	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
49	NC_017484	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
50	NC_017484	ACC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
51	NC_017484	CAG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
52	NC_017484	ACC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
53	NC_017484	CAG	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
54	NC_017484	T	7	7	2579	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	385829561
55	NC_017484	CAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829561
56	NC_017484	GTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829561
57	NC_017484	AGA	2	6	2682	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829561
58	NC_017484	ATAAA	2	10	2816	2825	80 %	20 %	0 %	0 %	385829561
59	NC_017484	AAG	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829561
60	NC_017484	AAT	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829561
61	NC_017484	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
62	NC_017484	ATC	3	9	3215	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
63	NC_017484	T	6	6	3234	3239	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
64	NC_017484	T	7	7	3249	3255	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
65	NC_017484	TA	3	6	3313	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	385829562
66	NC_017484	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
67	NC_017484	T	6	6	3354	3359	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
68	NC_017484	TTTTG	2	10	3397	3406	0 %	80 %	20 %	0 %	385829562
69	NC_017484	GTTTGA	2	12	3556	3567	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385829562
70	NC_017484	GTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829562
71	NC_017484	CTT	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829562
72	NC_017484	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	385829562
73	NC_017484	TTTC	2	8	3814	3821	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
74	NC_017484	TCT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829562
75	NC_017484	TTTCTT	2	12	3853	3864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385829562
76	NC_017484	T	7	7	3867	3873	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
77	NC_017484	CTTT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
78	NC_017484	T	7	7	3936	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
79	NC_017484	T	6	6	3981	3986	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
80	NC_017484	T	7	7	4003	4009	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
81	NC_017484	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
82	NC_017484	GTC	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829562
83	NC_017484	GTTT	2	8	4135	4142	0 %	75 %	25 %	0 %	385829562
84	NC_017484	AAT	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
85	NC_017484	GGAC	2	8	4218	4225	25 %	0 %	50 %	25 %	385829562
86	NC_017484	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
87	NC_017484	TTTC	2	8	4267	4274	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
88	NC_017484	ATTT	2	8	4306	4313	25 %	75 %	0 %	0 %	385829562
89	NC_017484	AAT	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
90	NC_017484	TCA	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
91	NC_017484	T	7	7	4509	4515	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
92	NC_017484	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
93	NC_017484	TCA	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
94	NC_017484	TGAA	2	8	4574	4581	50 %	25 %	25 %	0 %	385829562
95	NC_017484	T	6	6	4624	4629	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
96	NC_017484	TCA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
97	NC_017484	GAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829562
98	NC_017484	CCGTT	2	10	4681	4690	0 %	40 %	20 %	40 %	385829562
99	NC_017484	T	6	6	4720	4725	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
100	NC_017484	T	6	6	4761	4766	0 %	100 %	0 %	0 %	385829563
101	NC_017484	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
102	NC_017484	TGAT	2	8	4853	4860	25 %	50 %	25 %	0 %	385829563
103	NC_017484	ATT	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
104	NC_017484	ATA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829563
105	NC_017484	TTTC	2	8	5001	5008	0 %	75 %	0 %	25 %	385829563
106	NC_017484	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829563
107	NC_017484	TCT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829563
108	NC_017484	T	6	6	5053	5058	0 %	100 %	0 %	0 %	385829563
109	NC_017484	ATT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
110	NC_017484	T	6	6	5323	5328	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
111	NC_017484	AATT	2	8	5333	5340	50 %	50 %	0 %	0 %	385829564
112	NC_017484	T	7	7	5427	5433	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
113	NC_017484	TA	3	6	5439	5444	50 %	50 %	0 %	0 %	385829564
114	NC_017484	TTC	2	6	5454	5459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829564
115	NC_017484	T	6	6	5492	5497	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
116	NC_017484	ACT	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829564
117	NC_017484	T	8	8	5515	5522	0 %	100 %	0 %	0 %	385829564
118	NC_017484	ATTT	2	8	5534	5541	25 %	75 %	0 %	0 %	385829564
119	NC_017484	T	6	6	5661	5666	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
120	NC_017484	T	6	6	5674	5679	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
121	NC_017484	T	8	8	5684	5691	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
122	NC_017484	TTCT	2	8	5719	5726	0 %	75 %	0 %	25 %	385829565
123	NC_017484	TCATTG	2	12	5728	5739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385829565
124	NC_017484	T	6	6	5741	5746	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
125	NC_017484	T	6	6	5785	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
126	NC_017484	AATT	2	8	5792	5799	50 %	50 %	0 %	0 %	385829565
127	NC_017484	TCA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829565
128	NC_017484	TCA	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829565
129	NC_017484	AAT	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829565
130	NC_017484	CTT	2	6	5986	5991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829565
131	NC_017484	CT	3	6	5994	5999	0 %	50 %	0 %	50 %	385829565
132	NC_017484	TTTC	2	8	6079	6086	0 %	75 %	0 %	25 %	385829565
133	NC_017484	CTG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829565
134	NC_017484	AAT	2	6	6180	6185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829565
135	NC_017484	ATC	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829565
136	NC_017484	GT	3	6	6257	6262	0 %	50 %	50 %	0 %	385829565
137	NC_017484	TATTT	2	10	6326	6335	20 %	80 %	0 %	0 %	385829565
138	NC_017484	T	6	6	6347	6352	0 %	100 %	0 %	0 %	385829565
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